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网络技术与信息安全研究所，是国家保密学院和信息安全本科专业的主要支撑。以本研究所为基础，支撑了信息内容分析技术国家工程实验室(哈尔滨)基地，黑龙江省新一代网络与信息保障技术重点实验室、黑龙江省新一代网络信息保障工程实验室、教育部互联网应用创新开放平台示范基地的建设，并是“军用水下智能机器人技术国防科技重点实验室”的重要组成部分。本研究所设有网络技术与安全、网络与信息安全、机器智能和机器感知3个基层学术研究团队，主要研究方向涵盖未来网络与信息保障、互联网与信息内容安全、机器感知与智能计算、网络安全态势感知、物联网与普适计算、认知网络与自律计算等内容。研究所共有教师16人，其中，教授5人、副教授5人、讲师5人;博士生导师4人、硕士生导师9人。研究所近年主持承担了包括国家重大专项、国家重点研发计划项目、军用973项目、国家863计划、国家信息安全重大工程、总装预研项目、国家自然科学基金项目、国家242信息安全计划项目、博士点基金优先领域资助计划项目在内的国家级和省部级项目50余项，获得各种国家级和省部级奖项近20项，发表高水平学术论文500余篇，取得发明专利30余项和软件著作权40余项。