“钻井工程”是在一级学科地质资源与地质工程下自设的学科。钻井工程是人类探查地下资源并将它们采出地面的必要通道。钻井工程是围绕油气井的建设和测量而实施的资金和技术密集型工程，主要包括钻井（含固井和录井）、测井、完井及测试等，涉及数学、物理学、化学、地质学、力学、机械、测量与控制等多种学科，是油气勘探开发的基本环节。
本专业主要研究油气田岩石与钻头、钻井液与完井液、井眼轨道控制、钻井参数优选、油气井压力预测与控制、固井与完井、注水、压裂与酸化。在职和兼职教师中有中科院、工程院院士、外籍院士和博导18名。拥有4700m2的实验室，有“科学钻探国家专业实验室”、“环境岩土技术”部级重点实验室和全尺寸“钻探实验大厅”。近五年来，紧密结合大陆科学钻探和三峡等国家重点工程，在钻探（井）新技术、地质灾害防治理等领域，完成科研项目105项，总经费三千万元，获国家级、省部级科技奖和国家专利几十项。近五年已培养博士和博士后117名，就业于国内外高校和科研、设计院所，每年供不应求。