复旦大学化学系创建于1926年。1952年进行院系调整时，原复旦大学、浙江大学、交通大学、同济大学、沪江大学、大同大学及震旦大学七校化学系合并成复旦大学化学系。化学系是我国为数不多的化学学科博士学位授权点之一。无机化学、分析化学、有机化学和物理化学四个二级学科均为博士点和硕士点。2002和2003年，化学生物学和应用化学分别设立博士点。
化学系师资力量雄厚，现有教授41名，（其中中科院院士4名（3名双聘），教育部长江特聘8名（3名讲座），复旦特聘3名，杰出青年基金获得者6名，博士生导师37名）。
化学系的科学研究工作，坚持突出创新，兼顾基础和应用，多年来一直承担国家、上海市及各部委的重要科研任务，是国家"973"计划的首席科学家单位。近年来化学系已拥有了价值上千万元的各种大型分析测试仪器，为物质的痕量检测与结构表征奠定了扎实的基础。
为适应社会对高层次人才的需求，化学系招收工程硕士，为在职人员提供了一个良好的学习平台，让学员能够系统地学习化学工程的基础理论和技术，并得到良好的训练，努力使学员成为化学工程领域的高级技术人才。
主要研究方向：
化学工艺与化学产品标准化、新型化学电池、精细有机化学、药物和医用材料的分子设计、工业催化、天然药物分离分析、分析仪器技术与仪器分析、废气与废水的分析及处理、纳米材料、功能材料
主要专业课程：
化学专业英语、高等仪器分析、高等有机合成、药物合成化学、工业化学化学工艺学、新催化材料、生物分子电分析化、高能电源化学、无机新材料的合成与表征、XPS技术及其在化学中的应用