生物医学工程领域是利用生命科学、电子信息科学、材料科学研究的新成果研究生物电子信息工程、生物医用材料、现代工程医学、现代医院监护系统、医学工程管理信息系统、远程医疗工程、高级医疗仪器系统、人工器官的工程领域。主要培养从事生物医学信息、医用仪器、医学影像、生物电子学、基因工程、人工器官、生物医用材料等方面研究开发、生产制造、检测与控制、管理与维修的高级工程技术人才。
生物医学是综合工程学、医学和生物学的理论和方法而发展起来的交叉边缘学科，基本任务是运用工程技术手段研究和解决生命科学，特别是医学中的有关问题，主要研究利用电子信息技术结合医学临床对人体信息进行无损或微损的提取和处理。生物医学是生物医学信息、医学影像技术、基因芯片、纳米技术、新材料等技术的学术研究和创新的基地，是与21世纪生物技术科业的形成和发展密切相关领域，是关系到提高医疗诊断水平和人类自身健康的重要工程领域。
生物医学工程领域由信息科学与工程学院主办，由电子工程系提供支撑。在学科分布上，拥有上海市重点学科1个，一级学科1个，博士后流动站1个，博士点1个，硕士点1个。
主要研究方向：医学信息技术与系统、医学超声工程、医学信号与图像处理、心脏起博与电生理、医学仪器与系统
主要专业课程：DSP技术及其应用、现代医学信号处理、心脏起搏器电生理、起搏与心率失常电治疗、电子系统设计、嵌入式系统、医学仪器与系统、医学超声学、硬组织的诊断方法及原理