有机化学是研究有机物质的来源与组成、合成与制备、结构与性质、反应与转化以及功能与作用机制的科学。有机化学的新理论、新反应、新方法不仅推动了化学学科的发展，同时也促进了该学科与生命科学、材料科学、信息科学和环境科学在更大程度上的交叉，进一步拓展了有机化学的研究领域。本专业注重培养有机化学基础知识扎实、专业知识深厚及相关基本技能娴熟,知识面宽、适应性强的理工结合型有机化学专业人才。我校有机化学学科可追溯到1958年院系调整之前龙康侯教授建立的有机化学教研室，其后经过多年的建设，目前已发展成为理论研究前沿、应用特色鲜明的有机化学专业。我校的有机化学学科队伍实力比较雄厚，目前有国家杰出青年基金获得者1人，博士生导师4人，硕士生导师13人（含应用有机化学）。
近年来形成了如下几个具有优势和特色的研究方向：01.有机合成化学02.天然产物与药用植物化学03.有机功能材料化学04.精细有机化学品化学05.化学生物学
本专业开设的主要专业课程有：理论有机化学、环境友好合成化学、有机波谱分析、色谱分离技术、有机物分离技术、化学生物学、生物有机化学、专题有机合成实验、金属有机化学等。近五年来承担了包括国家杰出青年科学基金、国家基金重点项目在内的大量国家、部省级科研项目与企业委托课题，取得了一系列具有国际先进水平的研究成果，在国内外同行中享有较高的声誉和学术地位。在AngewandteChemieInternationalEdition、JournaloftheAmericanChemicalSociety、ChemicalCommunications、JournalofOrganicChemistry、OrganicLetter、CrystalGrowthandDesign、GreenChemistry、《中国化学》等国内外重要学术刊物上发表论文140余篇，获得广东省科学技术奖多项。本专业毕业生可在科研院所、高等院校及事业行政部门从事与本专业有关的科学研究、教学和管理工作，也适合在化工、轻工、日化、石化、医药、食品、汽车企业和技术公司等从事新技术与新产品开发、生产组织、技术服务、质量检验和环境监控等技术工作。