中华人民共和国教育部直属高等学校指由中华人民共和国教育部直属管理的一批高等学校，是中央部门直属高等学校的重要组成部分。目前全国范围共有75所高校。具体名单如下：
| 北京大学 | 清华大学 | 中国人民大学 |
| 北京师范大学 | 中国农业大学 | 北京外国语大学 |
| 北京语言大学 | 北京科技大学 | 北京化工大学 |
| 北京交通大学 | 北京邮电大学 | 中国地质大学（北京） |
| 中国矿业大学（北京） | 中国石油大学（北京） | 北京林业大学 |
| 中国传媒大学 | 中央财经大学 | 中国政法大学 |
| 中央音乐学院 | 中央戏剧学院 | 中央美术学院 |
| 北京中医药大学 | 对外经济贸易大学 | 华北电力大学 |
| 南开大学 | 天津大学 | 大连理工大学 |
| 东北大学 | 吉林大学 | 东北师范大学 |
| 东北林业大学 | 复旦大学 | 上海交通大学 |
| 同济大学 | 华东理工大学 | 东华大学 |
| 华东师范大学 | 上海外国语大学 | 上海财经大学 |
| 南京大学 | 东南大学 | 中国矿业大学 |
| 河海大学 | 江南大学 | 南京农业大学 |
| 中国药科大学 | 合肥工业大学 | 浙江大学 |
| 厦门大学 | 山东大学 | 中国海洋大学 |
| 中国石油大学（华东） | 武汉大学 | 华中科技大学 |
| 中国地质大学（武汉） | 武汉理工大学 | 华中师范大学 |
| 华中农业大学 | 中南财经政法大学 | 中南大学 |
| 湖南大学 | 中山大学 | 华南理工大学 |
| 重庆大学 | 西南大学 | 四川大学 |
| 西南财经大学 | 西南交通大学 | 电子科技大学 |
| 西安交通大学 | 西北农林科技大学 | 陕西师范大学 |
| 西安电子科技大学 | 长安大学 | 兰州大学 |
注：
(1)红色字体为：c9联盟成员高校;
(2)同一高校：中国地质大学(北京 武汉)、中国矿业大学和中国矿业大学(北京)、中国石油大学(北京 华东)
(3)教育部直属师范大学：北京师范大学、华东师范大学、东北师范大学、华中师范大学、陕西师范大学、西南大学(即原西南师范大学)。