森林保护学科创建于1958年，2003年被列为省级重点学科，2012年成功申请省重中之重学科，为学校首批硕士点，现学科带头人为张立钦教授。该学科拥有一支结构合理的学术队伍，现有教授9人，研究员2人，副教授15人，博士23人，浙江省“151”人才12人，高校中青年学科带头人2名，森林保护学为国家级教学团队。
经多年发展，形成了森林昆虫学、森林病理学、生物农药、森林微生物学、野生经济动物保护与利用5个具有鲜明特色与优势的研究方向。近5年承担省部级以上项目96项，总经费1263.5万元。获国家教学成果二等奖1项，省部级科技奖励24项，发表学术论文129篇，其中SCI收录46篇，主编出版专著、教材43部。学科总体水平在国内同类学科中处于先进行列，尤其在有害生物无公害控制研究、菌蚊与自然保护区昆虫资源研究等方面已处于国际先进水平。