管理科学与工程是沈阳大学首批授权一级硕士点学科，其侧重于研究生产与经营、经济与社会等领域的管理问题。管理科学应用现代科学方法与科技成就，阐明和揭示人类管理活动的基本规律，研究从事管理活动的基本理论与方法，它是涉及自然与社会、定量与定性、理论与实践相结合的综合性交叉学科。而管理工程则是管理科学的工程化体现，是管理者在多变的客观环境下设法运用各种资源达到既定目标的活动过程。本学科设置系统工程与运筹学、工业工程与管理、信息管理与商务智能、物流工程与管理、人力与资源管理、资本运营与风险管理，可根据学生的自身情况和专业背景授予工学类硕士学位或管理学类硕士学位。
本学科依托辽宁省装备制造综合自动化重点实验室，建有管理科学与工程开放实验室、虚拟物流综合实验室，柔性制造系统实验室、ERP与MES模拟实验室、工业工程综合实验室;拥有一支专兼结合、结构合理、治学严谨，教育和科研水平高，满足创新人才培养需要的师资队伍，队伍中专兼职人员累计20人，其中教授和副教授各6人，有20人具有博士学位。近五年来，主持承担各类科研课题20余项，其中国家自然科学基金2项，国家社会科学重点基金1项，省自然科学基金4项;累计获得科研经费700余万元。