本专业背靠国家工业微生物菌种资源共享平台、国家食品质量监督检验中心、全国食品发酵标准化中心、全国食品与发酵工业信息中心、国家食用菌研究开发中心、食品生物技术国际培训中心等六个国家级平台，拥有各种全自动发酵罐、高效液相色谱仪、气相色谱仪、原子吸收及荧光光谱仪、紫外光谱仪、旋光仪、纤维素分析仪、质谱仪等仪器设备，主要研究有：工业微生物菌种资源管理、微生物菌种分子生物学鉴定、食品与发酵产品快速检测与分析技术研究、酿酒与工业发酵工业标准化基础研究、药膳真菌功能因子高效发酵技术的研究、酿酒新技术、新方法的研究、新型功能性生物产品的开发、传统发酵工业技术的改造等。
一、培养目标
学位获得者应掌握生化工程和发酵工程方面的基础理论和专业知识，了解生物技术的最新发展动向，能够创造性地运用代谢调控、发酵动力学与生物反应器、生物分离等方面的原理和知识，研究和解决生物催化与转化等有关过程中的理论和实际问题，熟练掌握一门外国语。
二、主要研究方向
1.功能性生物制品的研究与开发
工业微生物菌种资源管理与共享、BIOLOG微生物菌种鉴定系统、微生物菌种分子生物学鉴定、功能性生物产品与环境工程的研究、有机酸发酵和下游过程研究、天然产物的分离和功能性研究、工业微生物与代谢产品开发。
2. 高新技术在传统食品工业中的应用
酿酒原料生产、安全及质量评价综合技术、酿造关键技术的研究、感官品评技术和检测方法开发、通过新型生物催化和反应器技术提升传统发酵产品的生物技术化水平、应用生物技术进行蛋白改性技术的研究、传统发酵调味品生产技术的研究、饲用微生物制剂研究、药膳真菌功能因子高效发酵技术的研究、药膳真菌新型生物发酵反应器研究。
3. 食品安全体系的建设与研究
食品与发酵工业标准化基础研究、标准化仪器的应用性研究与开发、食品与发酵行业标准体系建设、GMP和食品安全技术—HACCP体系的研究与开发、食品安全技术、食品与发酵产品快速检测技术的研究与开发。
4、应用生物技术对食品新资源、新品种的研究与开发
天然生物活性成分提取、制备与低温分离、 生物技术在农产品加工中的应用、大豆及植物蛋白加工技术、应用发酵食品的理论与实践、营养支持理论与实践。
5、食源性蛋白改性及深加工技术的研究与开发
以各种食用蛋白资源，尤其是低值副产物，如豆粕、玉米黄粉、小麦蛋白以及传统药用蛋白等为原料，采用生物酶工程技术，对其蛋白质进行改性、提纯，制成可食用的新一代蛋白原料-食源性低聚肽，提高其营养价值、生理活性和利用性。