广西中医药大学现有5个一级学科硕士点，40个二级学科硕士点，2014年拟招收硕士研究生450人，实际招生人数以当年教育部下达的招生计划为准，包括非定向就业、定向就业两类。
广西中医药大学原名广西中医学院，前身为1934年成立的广西省立医药研究所，是国内最早培养本科层次的省立中医药教育、科研和临床机构。学校新建于1956年，是我国创办较早的高等中医药院校之一，是我国5个少数民族自治区中唯一独立建制的高等中医药学府，是我国改革开放后第一批获得教育部授权开办研究生教育的中医药院校，是广西高校及西部12个省区高等中医药院校中最早获得教育部本科教学工作水平评估“优秀”结论的高校。1964年恢复本科教育，1970年南宁医学专科学校(原南宁大学医学院)并入，组成新的广西中医学院。1976年开始留学生教育，1978年开始研究生教育，1996年开始联合培养博士研究生，2009年开始联合培养博士后， 2012年3月29日经国家教育部批准正式更名为广西中医药大学。