为推进高层次人才培养的国际化进程，鼓励研究生参与国际交流活动，哈尔滨工程大学将资助工作纳入常规性专项规划，今年计划投入230万元人民币用于资助研究生参加国际学术交流。
哈尔滨工程大学2010年制定了《关于资助高层次创新人才国际交流的实施方案》，并于近日重新修订了《研究生国际交流资助实施方案》。资助类别主要为研究生参加高水平国际学术会议和研究生短期（6个月以内）国际学术交流。资助额度向博士研究生倾斜，鼓励博士研究生参加国外举办的国际学术会议。
2013年，学校启动了第三批研究生国际交流资助。截止到2013年4月底，共资助研究生26人参加高水平国际学术交流，出国人员所占比例为88.5%，拟资助金额为45.5万元。2010年至2012年，哈尔滨工程大学已分两批次共计180余万元资助293名研究生进行国际交流，出国人员比例为25.3%。研究生出席国际会议的地点覆盖美国、英国、新加坡、澳大利亚、日本等世界十多个国家和地区。参与高水平国际会议对拓展研究生学术视野、了解本学科前沿发展动态有重要作用。