本一级学科中，全国具有“博士一级”授权的高校共27所，本次有20所参评；还有部分具有“博士二级”授权和硕士授权的高校参加了评估；参评高校共计48所。 注：以下相同得分按学校代码顺序排列。
学科评估高校排名：1007药学(2012年)
| 学校代码及名称 | 学科整体水平得分 |
| 10001 北京大学 | 91 |
| 10023 北京协和医学院 | 89 |
| 10316 中国药科大学 | 88 |
| 10163 沈阳药科大学 | 86 |
| 10246 复旦大学 | 82 |
| 90030 第二军医大学 | |
| 10335 浙江大学 | 79 |
| 10610 四川大学 | |
| 10226 哈尔滨医科大学 | 78 |
| 10248 上海交通大学 | 76 |
| 10422 山东大学 | |
| 10423 中国海洋大学 | |
| 10533 中南大学 | |
| 10558 中山大学 | |
| 90032 第四军医大学 | |
| 10487 华中科技大学 | 73 |
| 10159 中国医科大学 | 72 |
| 10285 苏州大学 | |
| 10698 西安交通大学 | |
| 10025 首都医科大学 | 71 |
| 10062 天津医科大学 | |
| 10337 浙江工业大学 | |
| 10343 温州医学院 | |
| 10366 安徽医科大学 | |
| 10486 武汉大学 | |
| 10631 重庆医科大学 | |
| 10055 南开大学 | 70 |
| 10459 郑州大学 | |
| 10598 广西医科大学 | 69 |
| 10730 兰州大学 | |
| 10760 新疆医科大学 | |
| 11066 烟台大学 | |
| 10184 延边大学 | 68 |
| 10299 江苏大学 | |
| 10635 西南大学 | |
| 10161 大连医科大学 | 66 |
| 10222 佳木斯大学 | |
| 10475 河南大学 | |
| 10759 石河子大学 | |
| 11065 青岛大学 | |
| 10010 北京化工大学 | 65 |
| 10149 沈阳化工大学 | |
| 10160 辽宁医学院 | |
| 10313 徐州医学院 | |
| 11660 重庆理工大学 | |
| 90115 解放军总医院（军医进修学院） | |
| 10496 武汉工业学院 | 64 |
| 11075 三峡大学 |