本一级学科中，全国具有“博士一级”授权的高校共20所，本次有16所参评；还有部分具有“博士二级”授权和硕士授权的高校参加了评估；参评高校共计28所。 注：以下相同得分按学校代码顺序排列。
学科评估高校排名：1008中药学(2012年)
| 学校代码及名称 | 学科整体水平得分 |
| 10268 上海中医药大学 | 91 |
| 10026 北京中医药大学 | 84 |
| 10063 天津中医药大学 | |
| 10315 南京中医药大学 | |
| 10316 中国药科大学 | |
| 10633 成都中医药大学 | |
| 10228 黑龙江中医药大学 | 79 |
| 10572 广州中医药大学 | |
| 10163 沈阳药科大学 | 77 |
| 10023 北京协和医学院 | 76 |
| 10559 暨南大学 | |
| 10344 浙江中医药大学 | 73 |
| 10441 山东中医药大学 | |
| 10162 辽宁中医药大学 | 72 |
| 10240 哈尔滨商业大学 | |
| 10471 河南中医学院 | |
| 10507 湖北中医药大学 | 70 |
| 10541 湖南中医药大学 | |
| 10486 武汉大学 | 69 |
| 10697 西北大学 | |
| 10635 西南大学 | 66 |
| 10136 内蒙古民族大学 | 65 |
| 10475 河南大学 | |
| 10524 中南民族大学 | |
| 10613 西南交通大学 | |
| 10716 陕西中医学院 | |
| 10735 甘肃中医学院 | |
| 11117 扬州大学 |