本一级学科中，全国具有“博士一级”授权的高校共21所，本次有18所参评；还有部分具有“博士二级”授权和硕士授权的高校参加了评估；参评高校共计51所。 注：以下相同得分按学校代码顺序排列。
学科评估高校排名：0832食品科学与工程(2012年)
| 学校代码及名称 | 学科整体水平得分 |
| 10295 江南大学 | 95 |
| 10019 中国农业大学 | 86 |
| 10561 华南理工大学 | 83 |
| 10403 南昌大学 | 81 |
| 10307 南京农业大学 | 79 |
| 10335 浙江大学 | 78 |
| 10423 中国海洋大学 | |
| 10224 东北农业大学 | 77 |
| 10299 江苏大学 | |
| 10057 天津科技大学 | 76 |
| 10504 华中农业大学 | |
| 10564 华南农业大学 | |
| 10712 西北农林科技大学 | |
| 10359 合肥工业大学 | 75 |
| 10463 河南工业大学 | |
| 10129 内蒙古农业大学 | 72 |
| 10152 大连工业大学 | |
| 10248 上海交通大学 | |
| 10264 上海海洋大学 | |
| 10353 浙江工商大学 | |
| 10389 福建农林大学 | |
| 10635 西南大学 | |
| 10251 华东理工大学 | 70 |
| 10496 武汉工业学院 | |
| 10240 哈尔滨商业大学 | 69 |
| 10252 上海理工大学 | |
| 10086 河北农业大学 | 68 |
| 10327 南京财经大学 | |
| 10386 福州大学 | |
| 10538 中南林业科技大学 | |
| 10610 四川大学 | |
| 10733 甘肃农业大学 | |
| 11117 扬州大学 | |
| 10069 天津商业大学 | 67 |
| 10337 浙江工业大学 | |
| 10466 河南农业大学 | |
| 10467 河南科技学院 | |
| 10708 陕西科技大学 | |
| 10020 北京农学院 | 66 |
| 10158 大连海洋大学 | |
| 10167 渤海大学 | |
| 10280 上海大学 | |
| 10319 南京师范大学 | |
| 10589 海南大学 | |
| 11417 北京联合大学 | |
| 11646 宁波大学 | |
| 10593 广西大学 | 65 |
| 10674 昆明理工大学 | |
| 10731 兰州理工大学 | |
| 10758 新疆农业大学 | |
| 10160 辽宁医学院 | 63 |