哈尔滨工业大学2015博士招生生物信息学考试大纲及参考书目
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考试科目：生物信息学 考试代码： [2285]
一、 考试要求
要求考生全面、系统地生物信息学的基本概念、基本原理、典型方法和实用技术，并且能灵活运用所学知识阐述解决生物信息中具体问题的方法和途径。
二、 考试内容
(1)分子生物学基础、序列数据库与数据挖掘基本概念;计算机数据结构类型与算法分析基本方法
(2)双序列比较、多序列比对的基本算法、改进策略
(3)DNA片段组装、DNA物理作图模型的生物学背景、模型与算法
(4)种系发生树与生物进化的构建分析、简约性和相容性概念等
(5)基因组重排相关概念及其算法思想
(6)RNA二级结构预测优化模型、蛋白质折叠与比配
(7)基因芯片基本知识，各种生物信息学芯片类型、设计原理;芯片数据分析流程，差异表达基因分析方法
(8)新一代测序原理及其数据形式
(9)DNA-seq，全基因DNA测序，遗传变异识别算法、注释及功能预测;RNA-seq测序数据的比对算法，选择性剪切识别算法，基因融合识别方法;ChIP-seq测序实验中peak识别算法，motif识别算法
三、 试卷结构
考试时间180时分钟，满分100分
1)题型结构：简答题、论述题、算法设计与分析题
2)内容结构：生物信息学基础知识，以及数据处理能力、逻辑思维能力、创新思维能力
四、 参考书目
1. [巴西]J. 塞图宝，J. 梅丹尼斯著，朱浩等译。计算分子生物学导论。北京：科学出版社，2003
2. 孙啸，陆祖宏 谢建明。生物信息学基础。北京：清华大学出版社，2005